Sinode Gereja-gereja Anggota PGI
Saat ini terdapat 89 sinode gereja (yang terus bertambah) di bawah PGI, yang berkembang dari 26[3][4]
- Huria Kristen Batak Protestan(HKBP)
- Banua Niha Keriso Protestan(BNKP)
- Gereja Batak Karo Protestan(GBKP)
- Gereja Methodis Indonesia (GMI)
- Gereja Kalimantan Evangelis (GKE)
- Gereja Masehi Injili di Sangihe Talaud (GMIST)
- Gereja Masehi Injili di Minahasa(GMIM)
- Gereja Masehi Injili Bolaang Mongondow (GMIBM)
- Gereja Kristen Sulawesi Tengah(GKST)
- Gereja Toraja
- Gereja Toraja Mamasa (GTM)
- Gereja Kristen Sulawesi Selatan(GKSS)
- Gereja Protestan di Sulawesi Tenggara (GEPSULTRA)
- Gereja Masehi Injili Halmahera(GMIH)
- Gereja Protestan Maluku (GPM)
- Gereja Kristen Injili di Tanah Papua(GKI TP)
- Gereja Masehi Injili di Timor (GMIT)
- Gereja Kristen Sumba (GKS)
- Gereja Kristen Protestan Bali(GKPB)
- Greja Kristen Jawi Wetan (GKJW)
- Gereja Kristen Indonesia (GKI)
- Gereja Injili di Tanah Jawa (GITJ)
- Gereja Kristen Jawa (GKJ)
- Gereja Kristen Pasundan (GKP)
- Gereja Kristus (GK)
- Gereja Protestan di Indonesia bagian Barat (GPIB)
- Gereja Protestan di Indonesia (GPI)
- Gereja Isa Almasih (GIA)
- Gereja Kristen Muria Indonesia(GKMI)
- Gereja Kristen Protestan Simalungun (GKPS)
- Gereja Kristen Pemancar Injil(GKPI)
- Gereja Bethel Injil Sepenuh (GBIS)
- Gereja Pantekosta Pusat Surabaya(GPPS)
- Huria Kristen Indonesia (HKI)
- Gereja Kristen Luwuk Banggai(GKLB)
- Gereja Kristus Tuhan (GKT)
- Gereja Protestan Indonesia di Donggala (GPID)
- Gereja Punguan Kristen Batak(GPKB)
- Gereja Protestan Indonesia di Gorontalo (GPIG)
- Gereja Kristen Jawa Tengah Utara(GKJTU)
- Gereja Kristen Kalimantan Barat(GKKB)
- Gereja Gerakan Pantekosta (GGP)
- Gereja Kristen Protestan Indonesia(GKPI)
- Gereja Protestan Indonesia di Buol Toli-Toli (GPIBT)
- Gereja Kristen Protestan Mentawai(GKPM)
- Gereja Kristen Indonesia Sumatera Utara (GKI Sumut)
- Gereja Kristen Protestan Angkola(GKPA)
- Gereja Protestan Minahasa (KGPM)
- Gereja Mission Batak (GMB)
- Angowuloa Masehi Indonesia Nias(Gereja AMIN)
- Gereja Kristen Anugerah (GKA)
- Gereja Protestan Indonesia di Luwu(GPIL)
- Gereja Kebangunan Kalam Allah(GKKA)
- Gereja Kristen Kalam Kudus(GKKK)
- Orahua Niha Keriso Protestan(ONKP)
- Gereja Kristen di Sumatera Bagian Selatan (GKSBS)
- Gereja Protestan Kalimantan Barat(GKKB)
- Gereja Bethel Indonesia (GBI)
- Gereja Kristen Injili Indonesia (GKII)
- Gereja Masehi Injili Indonesia(GEMINDO)
- Gereja Kristen Injili di Indonesia(GEKISIA)
- Gereja Kristen Luther Indonesia(GKLI)
- Gereja Protestan Persekutuan(GPP)
- Gereja Kristen Setia Indonesia(GKSI)
- Gereja Tuhan di Indonesia (GTdI)
- Gereja Kristen Indonesia di Sulawesi Selatan (GKI Sulsel)
- Gereja Kristen Perjanjian Baru (GKPB)
- Angowuloa Fa'awosa Kho Yesu(AFY)
- Gereja Rehoboth (GR)
- Gereja Protestan Indonesia di Papua (GPI Papua)
- Gereja Kristen Protestan Pak Pak Dairi (GKPPD)
- Gereja Keesaan Injili Indonesia(GEKINDO)
- Gereja Masehi Protestan Umum(GMPU)
- Gereja Kristen Sulawesi Barat (GKSB)
- Gereja Kristen Oikoumene di Indonesia (GKO)
- Gereja Sahabat Indonesia (GSI)
- Gereja Utusan Pantekosta di Indonesia (GUPDI)
- Gereja Protestan Indonesia di Banggai Kepulauan (GPIBK)
- Gereja Masehi Injili di Talaud (Germita)
- Gereja Kristen Abdiel (GKA)
- Gereja Kristus Rahmani Indonesia(GKRI)
- Gereja Sidang-Sidang Jemaat Allah(GSJA)
- Gereja Kristus Yesus (GKY)
- Gereja Kristen Protestan Injili Indonesia (GKPII)
- Gereja Kemah Injil Indonesia (GKII)
- Gereja Protestan Soteria di Indonesia (GPSI)
- Gereja Kristen Sangkakala Indonesia (GKSI)
- Kerukunan Gereja Masehi Protestan Indonesia (KGMPI)
- Jemaat Kristen Indonesia (JKI)